Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd3Q14AI6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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