Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atp2b3Q0VF55 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp2b3Q0VF55 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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