Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms