Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Thbs3Q05895 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Thbs3Q05895 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Thbs3Q05895 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Thbs3Q05895 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Thbs3Q05895 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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