Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mmp11Q02853 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms