Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd1Q01822 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms