Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax8Q00288 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms