Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ppp4cP97470 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ppp4cP97470 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ppp4cP97470 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ppp4cP97470 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ppp4cP97470 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ppp4cP97470 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ppp4cP97470 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms