Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkp1P97350 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms