Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H3f3aP84244 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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