Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn18P56857 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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