Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CdaP56389 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CdaP56389 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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CdaP56389 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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CdaP56389 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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CdaP56389 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CdaP56389 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CdaP56389 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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