Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XpcP51612 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XpcP51612 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
XpcP51612 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
XpcP51612 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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