Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TspoP50637 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms