Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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VdrP48281 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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VdrP48281 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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VdrP48281 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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VdrP48281 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VdrP48281 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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