Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TpoP35419 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TpoP35419 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TpoP35419 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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TpoP35419 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TpoP35419 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TpoP35419 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TpoP35419 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TpoP35419 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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TpoP35419 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TpoP35419 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms