Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrbP28704 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrbP28704 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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