Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxraP28700 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxraP28700 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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