Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6bP23440 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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