Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pou3f1P21952 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms