Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P20040 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P20040 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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