Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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