Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox5bP19536 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms