Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnnc1P19123 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms