Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Hoxb1P17919 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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