Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou4f1P17208 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms