Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irf1P15314 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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