Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd4P10628 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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