Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P01747 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
P01747 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
P01747 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms