Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01662 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01662 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01662 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01662 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01662 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01662 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01662 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01662 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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