Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl20O89093 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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