Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxq1O70220 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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