Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sdc4O35988 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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