Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Opn1mwO35599 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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