Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms