Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GclmO09172 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GclmO09172 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GclmO09172 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms