Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms