Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm2888K7N746 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm2888K7N746 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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