Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm8888J3QPX5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8888J3QPX5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8888J3QPX5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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