Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm5225J3QPL3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms