Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3415J3QMS8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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