Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21818J3KMS6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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