Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp408H7BX78 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms