Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Srp72F8VQC1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Srp72F8VQC1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Srp72F8VQC1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Srp72F8VQC1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Srp72F8VQC1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Srp72F8VQC1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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