Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8247F6VRJ8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm8247F6VRJ8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm8247F6VRJ8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm8247F6VRJ8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8247F6VRJ8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms