Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hectd4E9Q2E4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms