Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brd1E9PZ26 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms