Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc8E9PWG2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms