Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3298E9PW80 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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