Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syce3B5KM66 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms